药学部是集药品调剂、静脉用药配置、临床药学、药学服务、药事管理、教学、科研为一体的具有管理职能的综合性业务科室，负责本部、东区（分院）和西海岸（分院）三个院区所有的药事工作。
药学部下设：药品调剂科、临床药学科、制剂室、静脉用药调配中心、东区（分院）药品调剂科、西海岸（分院）药品调剂科六个二级科室，其中药品调剂科下设门诊药房、急诊药房、病房药房、中药房、摆药室、脑科医院药房6个部门。临床药学科设有临床药师工作室、科研实验室、临床药物试验办公室、药物信息室等。2012年各药房共调剂药品金额13亿元。
学科带头人兼任卫生部合理用药专家委员会临床药学专业组专家、中国药理学会药物基因组学专业委员会常委、山东省医学会临床个体化用药检测与指导分会主委、青岛市生理学会药事管理委员会主任委员、青岛市医学会药事管理专业委员会副主委、青岛市医学会临床药学专业分会副主委、《中国医刊》杂志副主编、《中国药房》、《中国临床医生》等杂志编委等多项社会任职。
科学研究
1、科研立项：国家自然基金课题1项、山东省自然科学基金2项、其他科研立项20余项。
2、发表论文和著作：发表学术论文200多篇，第一作者发表SCI收录论文5篇。主编、副主编著作近30部。
3、获奖：国家科技进步奖二等奖1项、省市级奖励20余项。
2012年获批为卫生部临床药师培训基地，承担抗肿瘤药物和肾病两个专业的临床药师培训工作，目前有4名省内外学员接受培训。本科室还是是青岛大学医学院、山东省医学高等专科学校、青岛市卫生学校等大专院校的实习基地，分别承担硕士研究生、本科生和专科生的培养带教工作。
技术优势与特色
1、基因检测与个体化用药：科室有专门基因检测的实验室，并与周宏灏院士合作于2012建成“中南大学湘雅医学检验所青岛分中心分子诊断实验室”，目前已开展CYP2C19、ALDH2、抗肿瘤药物及抗乙肝病毒药物相关基因等二十余项检测，已完成一千余例的个体化用药指导。
2、新药药理学研究：与青岛大学医学院联合建设海洋药物开发实验室和青岛大学医学院临床药理研究所，参与多项国家自然科学基金，开发新药多个。
3、临床试验：1998年获批国家药物临床试验机构，经过逐步发展目前已有12个临床专业获批。2013年我院药物临床试验机构、伦理和12个临床专业均顺利通过国家食品药品监督管理局的资格认定复核。近5年参加近百项临床试验。
